Přeměna surových organických látek na půdní humus. Odumřelé organické látky podléhají vlivem půdní mikrofauny a mikroflóry složitým přeměnám závisejícím zejména na charakteru výchozích organických látek, ekologických půdních podmínkách a charakteru mikroflóry a mikrofauny. Specifickým příkladem humifikace je rašelinění, tedy hromadění a přeměna organických látek na rašelinu, většinou v podmínkách omezeného přístupu vzduchu a dlouhodobého nadbytku vody. Humifikace je nejvýznamnější v horizontech nadložního humusu a organominerálních A horizontech (Ah, Ai, Ad,…).Je to půdní proces dominantní v iniciálních půdách černozemi a černici, nicméně vyskytuje se ve všech půdních typech popisovaných v tomto projektu.